Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5P49615 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5P49615 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5P49615 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5P49615 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdk5P49615 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5P49615 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5P49615 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5P49615 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5P49615 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5P49615 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5P49615 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5P49615 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5P49615 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5P49615 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5P49615 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdk5P49615 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdk5P49615 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdk5P49615 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdk5P49615 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdk5P49615 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdk5P49615 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdk5P49615 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdk5P49615 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdk5P49615 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdk5P49615 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms