Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpreP49446 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpreP49446 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpreP49446 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpreP49446 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpreP49446 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtpreP49446 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtpreP49446 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpreP49446 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms