Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Rfx1P48377 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfx1P48377 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms