Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax9P47242 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax9P47242 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax9P47242 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax9P47242 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax9P47242 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax9P47242 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pax9P47242 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax9P47242 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms