Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax7P47239 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax7P47239 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax7P47239 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax7P47239 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax7P47239 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax7P47239 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax7P47239 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax7P47239 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms