Protein–RNA interactions for Protein: P43252

Ptgir, Prostacyclin receptor, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgirP43252 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtgirP43252 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PtgirP43252 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtgirP43252 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtgirP43252 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgirP43252 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgirP43252 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtgirP43252 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms