Protein–RNA interactions for Protein: P42703

Lifr, Leukemia inhibitory factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,092 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LifrP42703 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LifrP42703 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LifrP42703 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LifrP42703 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LifrP42703 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LifrP42703 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LifrP42703 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LifrP42703 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LifrP42703 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LifrP42703 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LifrP42703 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LifrP42703 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LifrP42703 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LifrP42703 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LifrP42703 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LifrP42703 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LifrP42703 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LifrP42703 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LifrP42703 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LifrP42703 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LifrP42703 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LifrP42703 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LifrP42703 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LifrP42703 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LifrP42703 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LifrP42703 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LifrP42703 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LifrP42703 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LifrP42703 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LifrP42703 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LifrP42703 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LifrP42703 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LifrP42703 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LifrP42703 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LifrP42703 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LifrP42703 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LifrP42703 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LifrP42703 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LifrP42703 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LifrP42703 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LifrP42703 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LifrP42703 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LifrP42703 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LifrP42703 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LifrP42703 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LifrP42703 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LifrP42703 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LifrP42703 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LifrP42703 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LifrP42703 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LifrP42703 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LifrP42703 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LifrP42703 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LifrP42703 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LifrP42703 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LifrP42703 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LifrP42703 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LifrP42703 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LifrP42703 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LifrP42703 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LifrP42703 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LifrP42703 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LifrP42703 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LifrP42703 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LifrP42703 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LifrP42703 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LifrP42703 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LifrP42703 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LifrP42703 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LifrP42703 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LifrP42703 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LifrP42703 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LifrP42703 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LifrP42703 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LifrP42703 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LifrP42703 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LifrP42703 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LifrP42703 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LifrP42703 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LifrP42703 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LifrP42703 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LifrP42703 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LifrP42703 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LifrP42703 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LifrP42703 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LifrP42703 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LifrP42703 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LifrP42703 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LifrP42703 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LifrP42703 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LifrP42703 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LifrP42703 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LifrP42703 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LifrP42703 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LifrP42703 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LifrP42703 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LifrP42703 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LifrP42703 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LifrP42703 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LifrP42703 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms