Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx2-5P42582 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms