Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pik3caP42337 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pik3caP42337 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms