Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rpl28P41105 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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