Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syt4P40749 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syt4P40749 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Syt4P40749 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syt4P40749 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syt4P40749 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syt4P40749 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syt4P40749 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syt4P40749 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syt4P40749 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syt4P40749 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syt4P40749 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syt4P40749 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Syt4P40749 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syt4P40749 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syt4P40749 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syt4P40749 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syt4P40749 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syt4P40749 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syt4P40749 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syt4P40749 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syt4P40749 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syt4P40749 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syt4P40749 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syt4P40749 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt4P40749 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt4P40749 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms