Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VhlP40338 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VhlP40338 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VhlP40338 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VhlP40338 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VhlP40338 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VhlP40338 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VhlP40338 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VhlP40338 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VhlP40338 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VhlP40338 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VhlP40338 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VhlP40338 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VhlP40338 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VhlP40338 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VhlP40338 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VhlP40338 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VhlP40338 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VhlP40338 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VhlP40338 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VhlP40338 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VhlP40338 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VhlP40338 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VhlP40338 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VhlP40338 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VhlP40338 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VhlP40338 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VhlP40338 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VhlP40338 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VhlP40338 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VhlP40338 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VhlP40338 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VhlP40338 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VhlP40338 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VhlP40338 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VhlP40338 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VhlP40338 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VhlP40338 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VhlP40338 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VhlP40338 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VhlP40338 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VhlP40338 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VhlP40338 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VhlP40338 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VhlP40338 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VhlP40338 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VhlP40338 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VhlP40338 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VhlP40338 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VhlP40338 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VhlP40338 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VhlP40338 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VhlP40338 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VhlP40338 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VhlP40338 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VhlP40338 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VhlP40338 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VhlP40338 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VhlP40338 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VhlP40338 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VhlP40338 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VhlP40338 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VhlP40338 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VhlP40338 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VhlP40338 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VhlP40338 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VhlP40338 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VhlP40338 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VhlP40338 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VhlP40338 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VhlP40338 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VhlP40338 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VhlP40338 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VhlP40338 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VhlP40338 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VhlP40338 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VhlP40338 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VhlP40338 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VhlP40338 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VhlP40338 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VhlP40338 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VhlP40338 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VhlP40338 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VhlP40338 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VhlP40338 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VhlP40338 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VhlP40338 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VhlP40338 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VhlP40338 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VhlP40338 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VhlP40338 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VhlP40338 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VhlP40338 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VhlP40338 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VhlP40338 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VhlP40338 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VhlP40338 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VhlP40338 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VhlP40338 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VhlP40338 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms