Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cap1P40124 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cap1P40124 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cap1P40124 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cap1P40124 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cap1P40124 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cap1P40124 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cap1P40124 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cap1P40124 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cap1P40124 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cap1P40124 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cap1P40124 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms