Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timp3P39876 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Timp3P39876 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timp3P39876 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timp3P39876 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timp3P39876 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp3P39876 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp3P39876 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Timp3P39876 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms