Protein–RNA interactions for Protein: P38649

Abo, Histo-blood group ABO system transferase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AboP38649 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AboP38649 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AboP38649 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AboP38649 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AboP38649 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AboP38649 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AboP38649 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AboP38649 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AboP38649 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AboP38649 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
AboP38649 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AboP38649 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AboP38649 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AboP38649 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AboP38649 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AboP38649 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AboP38649 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AboP38649 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AboP38649 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AboP38649 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AboP38649 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AboP38649 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AboP38649 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AboP38649 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AboP38649 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AboP38649 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AboP38649 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AboP38649 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AboP38649 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AboP38649 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AboP38649 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AboP38649 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AboP38649 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AboP38649 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AboP38649 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AboP38649 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AboP38649 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AboP38649 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AboP38649 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AboP38649 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AboP38649 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AboP38649 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AboP38649 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AboP38649 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AboP38649 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AboP38649 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AboP38649 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AboP38649 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AboP38649 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AboP38649 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AboP38649 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AboP38649 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AboP38649 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AboP38649 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AboP38649 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AboP38649 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AboP38649 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AboP38649 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AboP38649 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AboP38649 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AboP38649 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AboP38649 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AboP38649 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AboP38649 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AboP38649 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AboP38649 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AboP38649 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AboP38649 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AboP38649 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AboP38649 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AboP38649 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AboP38649 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AboP38649 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AboP38649 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AboP38649 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AboP38649 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AboP38649 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AboP38649 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AboP38649 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AboP38649 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AboP38649 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AboP38649 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AboP38649 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
AboP38649 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AboP38649 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AboP38649 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AboP38649 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AboP38649 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AboP38649 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AboP38649 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AboP38649 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AboP38649 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AboP38649 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AboP38649 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
AboP38649 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AboP38649 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AboP38649 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AboP38649 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
AboP38649 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AboP38649 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms