Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PpargP37238 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PpargP37238 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PpargP37238 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PpargP37238 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PpargP37238 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PpargP37238 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PpargP37238 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PpargP37238 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PpargP37238 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PpargP37238 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PpargP37238 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PpargP37238 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PpargP37238 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PpargP37238 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PpargP37238 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PpargP37238 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PpargP37238 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PpargP37238 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PpargP37238 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PpargP37238 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PpargP37238 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PpargP37238 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PpargP37238 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PpargP37238 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PpargP37238 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PpargP37238 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PpargP37238 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PpargP37238 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PpargP37238 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PpargP37238 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PpargP37238 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PpargP37238 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PpargP37238 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PpargP37238 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PpargP37238 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PpargP37238 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PpargP37238 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PpargP37238 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PpargP37238 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PpargP37238 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PpargP37238 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PpargP37238 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PpargP37238 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PpargP37238 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PpargP37238 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PpargP37238 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PpargP37238 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PpargP37238 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PpargP37238 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PpargP37238 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PpargP37238 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PpargP37238 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PpargP37238 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpargP37238 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpargP37238 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpargP37238 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpargP37238 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PpargP37238 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpargP37238 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PpargP37238 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpargP37238 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpargP37238 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpargP37238 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpargP37238 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpargP37238 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpargP37238 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpargP37238 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpargP37238 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpargP37238 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpargP37238 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpargP37238 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpargP37238 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpargP37238 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpargP37238 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpargP37238 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpargP37238 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpargP37238 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpargP37238 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpargP37238 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PpargP37238 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PpargP37238 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PpargP37238 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PpargP37238 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PpargP37238 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PpargP37238 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PpargP37238 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PpargP37238 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PpargP37238 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PpargP37238 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PpargP37238 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PpargP37238 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PpargP37238 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PpargP37238 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PpargP37238 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PpargP37238 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PpargP37238 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PpargP37238 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PpargP37238 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PpargP37238 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms