Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Grin2aP35436 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Grin2aP35436 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Grin2aP35436 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Grin2aP35436 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Grin2aP35436 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Grin2aP35436 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Grin2aP35436 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Grin2aP35436 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Grin2aP35436 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Grin2aP35436 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Grin2aP35436 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Grin2aP35436 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Grin2aP35436 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Grin2aP35436 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Grin2aP35436 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Grin2aP35436 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Grin2aP35436 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Grin2aP35436 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms