Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp4P35123 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp4P35123 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp4P35123 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp4P35123 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp4P35123 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp4P35123 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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