Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptk2P34152 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms