Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2aP34056 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2aP34056 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2aP34056 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2aP34056 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2aP34056 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2aP34056 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tfap2aP34056 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tfap2aP34056 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2aP34056 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms