Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxa11P31311 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms