Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa2P31245 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa2P31245 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms