Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd28P31041 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd28P31041 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd28P31041 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd28P31041 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cd28P31041 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd28P31041 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd28P31041 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd28P31041 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd28P31041 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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