Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkcdP28867 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms