Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kif5cP28738 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif5cP28738 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms