Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RxraP28700 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RxraP28700 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RxraP28700 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RxraP28700 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RxraP28700 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RxraP28700 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RxraP28700 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RxraP28700 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RxraP28700 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RxraP28700 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RxraP28700 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RxraP28700 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RxraP28700 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RxraP28700 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RxraP28700 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RxraP28700 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RxraP28700 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RxraP28700 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RxraP28700 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RxraP28700 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RxraP28700 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RxraP28700 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RxraP28700 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RxraP28700 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RxraP28700 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RxraP28700 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RxraP28700 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RxraP28700 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RxraP28700 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RxraP28700 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RxraP28700 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RxraP28700 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RxraP28700 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RxraP28700 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RxraP28700 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RxraP28700 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RxraP28700 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RxraP28700 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RxraP28700 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RxraP28700 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RxraP28700 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RxraP28700 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RxraP28700 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RxraP28700 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RxraP28700 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RxraP28700 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RxraP28700 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RxraP28700 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RxraP28700 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RxraP28700 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RxraP28700 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RxraP28700 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RxraP28700 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RxraP28700 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RxraP28700 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RxraP28700 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RxraP28700 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RxraP28700 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RxraP28700 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RxraP28700 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RxraP28700 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RxraP28700 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RxraP28700 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RxraP28700 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RxraP28700 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RxraP28700 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RxraP28700 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RxraP28700 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RxraP28700 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RxraP28700 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RxraP28700 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RxraP28700 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RxraP28700 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RxraP28700 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RxraP28700 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RxraP28700 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RxraP28700 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RxraP28700 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RxraP28700 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RxraP28700 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RxraP28700 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RxraP28700 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RxraP28700 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RxraP28700 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RxraP28700 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RxraP28700 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RxraP28700 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RxraP28700 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RxraP28700 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RxraP28700 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RxraP28700 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RxraP28700 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RxraP28700 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RxraP28700 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RxraP28700 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RxraP28700 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RxraP28700 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RxraP28700 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RxraP28700 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms