Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms