Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms