Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CenpbP27790 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CenpbP27790 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CenpbP27790 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CenpbP27790 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CenpbP27790 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms