Protein–RNA interactions for Protein: P27681

Gabrg3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg3P27681 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrg3P27681 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrg3P27681 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms