Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChgaP26339 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChgaP26339 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChgaP26339 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChgaP26339 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChgaP26339 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ChgaP26339 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChgaP26339 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChgaP26339 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChgaP26339 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChgaP26339 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChgaP26339 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChgaP26339 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms