Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmo2P25801 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmo2P25801 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms