Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnd1P25322 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnd1P25322 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnd1P25322 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnd1P25322 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnd1P25322 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnd1P25322 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnd1P25322 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnd1P25322 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnd1P25322 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnd1P25322 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnd1P25322 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccnd1P25322 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccnd1P25322 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccnd1P25322 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccnd1P25322 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccnd1P25322 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccnd1P25322 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccnd1P25322 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnd1P25322 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms