Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htr3aP23979 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htr3aP23979 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms