Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hoxd11P23813 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd11P23813 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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