Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxd12P23812 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
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