Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfyaP23708 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfyaP23708 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NfyaP23708 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfyaP23708 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfyaP23708 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfyaP23708 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfyaP23708 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfyaP23708 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms