Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PparaP23204 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PparaP23204 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PparaP23204 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PparaP23204 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PparaP23204 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PparaP23204 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PparaP23204 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PparaP23204 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PparaP23204 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PparaP23204 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PparaP23204 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PparaP23204 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PparaP23204 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PparaP23204 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PparaP23204 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PparaP23204 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PparaP23204 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PparaP23204 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PparaP23204 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PparaP23204 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PparaP23204 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PparaP23204 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PparaP23204 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PparaP23204 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PparaP23204 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PparaP23204 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PparaP23204 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PparaP23204 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PparaP23204 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PparaP23204 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PparaP23204 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PparaP23204 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PparaP23204 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PparaP23204 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PparaP23204 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PparaP23204 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PparaP23204 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PparaP23204 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PparaP23204 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PparaP23204 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PparaP23204 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PparaP23204 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PparaP23204 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PparaP23204 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PparaP23204 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PparaP23204 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PparaP23204 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PparaP23204 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PparaP23204 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PparaP23204 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PparaP23204 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PparaP23204 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PparaP23204 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PparaP23204 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PparaP23204 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PparaP23204 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PparaP23204 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PparaP23204 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PparaP23204 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PparaP23204 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PparaP23204 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PparaP23204 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PparaP23204 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PparaP23204 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PparaP23204 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PparaP23204 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PparaP23204 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PparaP23204 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PparaP23204 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PparaP23204 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PparaP23204 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PparaP23204 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PparaP23204 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PparaP23204 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PparaP23204 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PparaP23204 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PparaP23204 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PparaP23204 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PparaP23204 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PparaP23204 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PparaP23204 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PparaP23204 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PparaP23204 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PparaP23204 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PparaP23204 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PparaP23204 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PparaP23204 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PparaP23204 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PparaP23204 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PparaP23204 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PparaP23204 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PparaP23204 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PparaP23204 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PparaP23204 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PparaP23204 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PparaP23204 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PparaP23204 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PparaP23204 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PparaP23204 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms