Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klra1P20937 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klra1P20937 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klra1P20937 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Klra1P20937 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klra1P20937 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klra1P20937 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klra1P20937 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klra1P20937 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klra1P20937 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klra1P20937 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klra1P20937 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms