Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prim1P20664 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prim1P20664 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prim1P20664 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prim1P20664 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prim1P20664 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prim1P20664 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Prim1P20664 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prim1P20664 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prim1P20664 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prim1P20664 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms