Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fcer1aP20489 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms