Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PdgfaP20033 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms