Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18529 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18529 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18529 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18529 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18529 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18529 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18529 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18529 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18529 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18529 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18529 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P18529 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18529 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18529 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P18529 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18529 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P18529 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18529 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18529 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18529 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18529 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18529 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18529 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18529 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18529 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18529 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18529 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P18529 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18529 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18529 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P18529 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18529 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18529 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18529 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18529 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18529 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P18529 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P18529 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P18529 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18529 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18529 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18529 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18529 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18529 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18529 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18529 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18529 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18529 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18529 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P18529 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P18529 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18529 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18529 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P18529 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18529 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18529 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18529 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18529 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18529 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18529 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18529 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18529 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18529 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18529 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18529 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18529 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18529 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18529 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18529 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18529 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18529 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18529 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18529 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18529 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18529 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18529 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18529 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18529 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18529 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18529 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18529 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18529 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18529 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18529 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18529 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18529 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18529 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18529 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18529 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18529 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18529 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18529 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18529 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18529 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18529 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18529 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18529 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18529 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18529 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms