Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl9P18340 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms