Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Hoxb1P17919 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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Hoxb1P17919 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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