Protein–RNA interactions for Protein: P11627

L1cam, Neural cell adhesion molecule L1, mousemouse

Predictions only

Length 1,260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1camP11627 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1camP11627 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1camP11627 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
L1camP11627 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1camP11627 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1camP11627 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1camP11627 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1camP11627 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
L1camP11627 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1camP11627 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1camP11627 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1camP11627 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1camP11627 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1camP11627 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1camP11627 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1camP11627 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1camP11627 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1camP11627 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1camP11627 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1camP11627 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1camP11627 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
L1camP11627 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1camP11627 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
L1camP11627 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1camP11627 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1camP11627 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1camP11627 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1camP11627 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1camP11627 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1camP11627 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
L1camP11627 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1camP11627 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1camP11627 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1camP11627 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
L1camP11627 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1camP11627 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1camP11627 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1camP11627 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1camP11627 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1camP11627 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1camP11627 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
L1camP11627 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1camP11627 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1camP11627 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1camP11627 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1camP11627 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1camP11627 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1camP11627 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1camP11627 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1camP11627 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1camP11627 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1camP11627 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
L1camP11627 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1camP11627 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1camP11627 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1camP11627 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
L1camP11627 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
L1camP11627 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1camP11627 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1camP11627 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
L1camP11627 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
L1camP11627 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
L1camP11627 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1camP11627 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1camP11627 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1camP11627 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1camP11627 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1camP11627 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1camP11627 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1camP11627 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1camP11627 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1camP11627 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
L1camP11627 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1camP11627 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1camP11627 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1camP11627 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1camP11627 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
L1camP11627 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1camP11627 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1camP11627 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1camP11627 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1camP11627 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1camP11627 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1camP11627 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1camP11627 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1camP11627 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1camP11627 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1camP11627 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1camP11627 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1camP11627 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1camP11627 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1camP11627 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1camP11627 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1camP11627 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1camP11627 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1camP11627 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1camP11627 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1camP11627 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1camP11627 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1camP11627 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms