Protein–RNA interactions for Protein: P11440

Cdk1, Cyclin-dependent kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk1P11440 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk1P11440 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk1P11440 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk1P11440 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk1P11440 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk1P11440 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk1P11440 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk1P11440 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk1P11440 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk1P11440 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk1P11440 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk1P11440 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk1P11440 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk1P11440 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk1P11440 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk1P11440 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk1P11440 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk1P11440 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk1P11440 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk1P11440 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk1P11440 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk1P11440 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk1P11440 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk1P11440 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk1P11440 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cdk1P11440 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms