Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fgf4P11403 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgf4P11403 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms