Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lire1P11260 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lire1P11260 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lire1P11260 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lire1P11260 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lire1P11260 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lire1P11260 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lire1P11260 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lire1P11260 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lire1P11260 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lire1P11260 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lire1P11260 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lire1P11260 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lire1P11260 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lire1P11260 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lire1P11260 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lire1P11260 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lire1P11260 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lire1P11260 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms