Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd4P10628 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd4P10628 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms